La BRI de la préfecture de police ne fait pas partie du dispositif des BRI de la DCPJ. Cette dichotomie se retrouve également entre les unités d'intervention de la préfecture de police de Paris et celles de la DCPJ, qui n'ont pas les mêmes missions. La préfecture de police possède ses propres directions – police judiciaire, renseignement, ordre public, circulation, etc. – et la DCPJ, quant à elle, possède ses propres BRI. Certains domaines de notre action, comme la lutte contre le crime organisé sous toutes ses formes, se rejoignent, notamment les missions de surveillance, de filature, d'interpellation des malfaiteurs en flagrant délit, avant qu'ils commettent une infraction grave ou peu après ; à la différence de la préfecture de police, néanmoins, la DCPJ n'est pas compétente en matière d'action anti-commando et en cas de retranchement à domicile d'un forcené ou de menace de suicide, par exemple.