Il serait préférable que la CNE soit transformée en autorité administrative indépendante, ce qui lui conférerait une autonomie de gestion administrative et financière. À cette fin, il conviendrait de prévoir un amendement correspondant dans une loi portant sur l'énergie, ce qui serait la solution la plus favorable. Actuellement, la CNE est critiquée. L'indépendance de ses membres est mise en cause par des opposants virulents, parfois de manière insultante.