Le CGI signe des conventions avec l'opérateur – l'Agence nationale de la recherche. Ces conventions ont été établies par lui en relation étroite avec le ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche, les éventuels conflits étant arbitrés au niveau du Premier ministre et la décision alors figée sous forme de « bleu » du Premier ministre – en pratique, pratiquement toutes les conventions sont « bleuies ».