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Avis défavorable. Les préfets assurent la cohérence de l'action publique et il est important que l'État ne perde pas ses moyens d'intervention sur le terrain. Il peut être amené à saisir l'agence sur de grands projets régionaux ou départementaux susceptibles de menacer la biodiversité ou, au contraire, de l'améliorer, et ce sont les préfets qui l'en informeront.