La compensation prévue en dernier recours dans le triptyque « éviter-réduire-compenser » est souvent très difficile à mettre en oeuvre, s'agissant par exemple d'une rupture de continuité écologique. Un organisme public doit pouvoir contrôler le bien-fondé et la réalisation effective des mesures prises. L'amendement tend à confier cette mission à l'Agence pour la biodiversité.