Pour la gouvernance territoriale, l'existence de comités d'orientation régionaux, en sus du comité d'orientation national, permet au dialogue entre l'État et la CDC de se nouer également au niveau territorial, puisqu'y siègent tant des représentants de l'un que de l'autre. Ces comités d'orientation représentent une nouveauté par rapport à la gouvernance classique par le conseil d'administration. Cela se traduit par une implication concrète dans les territoires, où Bpifrance s'appuie sur des antennes régionales, sans qu'il y ait cependant d'agence de Bpifrance dans chaque ville, comme pour une banque de détail privée.
Aussi Bpifrance passe-t-elle, comme établissement de place, des conventions avec des réseaux bancaires. Les entrepreneurs qui se rendent auprès de ces réseaux peuvent se voir proposer des produits de Bpifrance, voire en bénéficier directement grâce à des conventions de délégation passées, pour de petits montants, entre Bpifrance et les établissements bancaires privés.
Les présidents de régions avaient insisté pour que la décision de soutien puisse intervenir au niveau du chef d'agence régionale, en tenant compte des caractéristiques du tissu économique dans les différents territoires.