Il est nécessaire de faire approuver le SRDEII par le préfet. En effet, c'est cette approbation qui donne au document son caractère opposable. Le préfet doit, de son côté, s'assurer du respect de la procédure d'élaboration du schéma et de la préservation des intérêts nationaux – ces derniers ne renvoyant pas à l'ensemble des politiques nationales mais à des domaines bien identifiés.