L'EPRUS reçoit une subvention de l'État et une participation de l'assurance maladie, celle-ci ne servant pas à financer la réserve sanitaire mais seulement l'autre secteur d'activité de l'EPRUS. Le centre de Vitry-le-François sera donc financé à parité par la part Etat et la part assurance maladie. Cela représente 7 millions d'euros en 2013. La DILGA a rempli ses missions et il a été mis fin à ses fonctions.