La méthodologie appliquée en matière d'études de coûts permet de séparer les coûts de l'HAD des coûts de l'hôpital dans l'HAD intégrée. La méthodologie spécifie d'affecter toutes les charges à l'HAD, mais uniquement les charges de l'HAD. L'échantillon comprend des établissements qui sont à la fois centres hospitaliers et d'HAD. Les études de coûts étant réalisées dans le cadre d'une supervision, des prestataires sont chargés d'aller vérifier la qualité de la répartition des charges. Les superviseurs portent une attention particulière aux HAD qui sont intégrées dans des centres hospitaliers.