Il est clair qu'un bâtiment à basse consommation doit être très bien ventilé, et une étude de l'Agence Qualité Construction (AQC) a même montré que la ventilation était essentielle en cours de chantier, pour assurer l'évacuation de l'humidité libérée par les ciments. La qualité de la ventilation est également essentielle pour assurer le confort d'été. Ceci dit, les ventilations présentent des difficultés au niveau de la pose des conduits d'aération, et la France manque de compétences dans ce domaine. Pour l'attribution des labels d'Effinegie, il est demandé un test d'étanchéité des réseaux de conduits, car c'est un aspect critique des installations.