La MARTAA est plus spécifiquement en charge du secteur sanitaire. Mais l'Agence régionale de santé a structuré une mission d'appui régionale au secteur social (MARS) comparable à la MARTAA. Les deux missions coopèrent du reste étroitement et partagent leur personnel. Le délégué régional de la FEHAP s'implique également dans les activités des deux missions.
L'équipe de la MARTAA bénéficie d'un financement négocié avec l'ARS. Il a évolué au fil des années en fonction des différents projets et missions confiés à notre structure. Le budget prévisionnel annuel atteint ainsi environ un demi-million d'euros en 2015, sur lesquels sont financés nos sept axes de travail et de coopération.