Pour l'OIF, le ministère des Affaires étrangères est le principal contributeur. L'Agence française de développement (AFD) participe au financement de certaines actions, par exemple à celui du programme Initiative francophone pour la formation à distance des maîtres (IFADEM), sur lequel l'OIF et l'AUF travaillent en partenariat avec divers organismes, notamment de l'Union européenne. La part du ministère de la Culture est passée, quant à elle, de 500 000 à 190 000 euros au fil des ans et le ministère de l'Enseignement supérieur verse 2 millions d'euros par an à l'AUF. Enfin, entre 2011 et 2013, des crédits du cabinet du ministre des Affaires étrangères dits de « sortie de crise », d'un peu plus d'un million d'euros, ont été accordés pour des actions « fléchées », notamment en Guinée ou à Madagascar. En 2013, par exemple, ils ont atteint 1,3 million d'euros.